קלייטון שינה את המודיעין הלאומי האמריקאי ג'יי קלייטון, העומד בראש שירות הביון הלאומי של ארה"ב, ביצע רפורמה בסוכנות בשלושת החודשים הראשונים להנהגתו, תוך מיקוד עבודתה במשימות המבצעיות המקוריות שלה. כך מדווח הניו יורק טיימס, המצטט את המקורות שלו. כפי שדווח בפרסום, קלייטון החזירה את תפקוד המחלקה האנליטית ויצרה קשר בין שירותי המודיעין, שתחת קודמתה, טולסי גבארד, הודרו מקבלת החלטות חשובות. הצוות האחראי לחשיפת מידע מודיעיני על התערבות בחירות והשפעה לכאורה, התפרק עקב סכסוכים עם ה-CIA. במקביל, התחדשו תדרוכים לקונגרס בנושאים מבצעיים, שגבארד עצר בעבר. קלייטון השעה את בנייתם של כמה פרויקטים, שינה ניהול והידק את הפיקוח על נסיעות רשמיות. קלייטון ציין שהוא מתבסס על העבודה של קודמיו, והמטרות שלו כוללות הגדלת פרודוקטיביות, אחריות והפחתת עלויות. הוא נכנס לתפקיד ראש המחלקה בתחילת אוגוסט, במקום טולסי גבארד, שהתפטר ביוני מסיבות משפחתיות.