נמשך למרות זאת, צבא סודאן סירב למסור את הארון ואל-בשיר.
למרות שמבקרים מאשימים לעתים קרובות את הצבא בהתיישרות עם נאמני באשיר, הארון הכחיש כל תיאום ישיר בין ה-NCP לצבא סודן במהלך הראיון שלו, ואמר כי הם אמנם מאוחדים במלחמה נגד המיליציה של כוחות התמיכה המהירים (RSF) הנתמכת על ידי איחוד האמירויות, אבל הם אינם מיושרים פוליטית.
ואכן, לכידת הארון מדגישה את הקרע בין אל-בורהאן לאסלאמיסטים מהמשטר לשעבר, שביצעו ניסיונות הפיכה שונים נגד מפקד הצבא.
באוגוסט 2026, הוא השיק יוזמת שלום ותהליך מדיני "סודאני-סודני", אשר לא כללה את ה-NCP.
אל-בורהאן הכחיש שוב ושוב את הקשרים של הצבא לנאמני באשיר, ונשבע כי לא יאפשר למפלגה הקומוניסטית שהוצאה מחוץ לחוק לחזור לשלטון.
לדברי לינה יעקוב, ראש לשכת סודאן ב-טלוויזיה אל חדאת, הארון ניהל בחשאי את ה-NCP האסור בתוך סודן, מה שמרמז כי הופעתו הפומבית הפתאומית כנראה גרמה לרשויות להתחקות אחריו.