הקרע הגובר בין ההנהגה הפוליטית השלטת בישראל לבין מערכת הביטחון לא מסתכם במתיחות בין ראש הממשלה בנימין נתניהו לרמטכ"ל צה"ל אייל זמיר, אלא משתרע גם אל תוך המוסד. ראש המוסד שזה עתה מונה, רומן גופמן, תומך בעמדת נתניהו בדבר פתיחת פעולה צבאית נגד איראן לפני הבחירות הקרובות, אולם כמה בכירי המוסד מתנגדים למהלך כזה.