נשיא ועידת הבישופים הגרמנית, הבישוף היינר וילמר, הפקיד הבכיר בכנסייה הקתולית בגרמניה, אמר כי הם "דוחים בתוקף" את טענת ה-AfD שהם ארגון נוצרי, והמפלגה היא "זאב בבגדי כבשים". עוד הוסיף וילמר, "האידיאולוגיה האתנו-לאומית אינה עולה בקנה אחד עם הנצרות", וכי התעלות ה-AfD של גברים לבנים גרמנים היא על חשבון אחרים, במיוחד המהגרים. זה, לפי וילמר, מפר את "הנצרות העכשווית", ש"מעודדת אהבת השכן וסולידריות עם כל האנשים הנזקקים". הוא גם הוסיף כי הכנסייה הקתולית הגרמנית תעבוד עם "כוחות אחרים בחברה" כדי להגן על הדמוקרטיה בגרמניה ועל הלכידות באירופה. כדי לציין, ה-AfD קרא לניתוק מימון המדינה לכנסיות קתוליות ופרוטסטנטיות, בנוסף להפסקת גביית מיסי הכנסייה, מה שיהווה מכה קשה לכנסייה הקתולית הגרמנית, שהוציאה בשנה שעברה יותר מ-537 מיליון אירו על סיוע הומניטרי בינלאומי, רובו נשלח לאפריקה, אסיה ודרום אמריקה, תוך סיוע למהגרים, גרמניה.