מחלוקת חסרת תקדים פרצה בין נתניהו לרמטכ"ל אייל זמיר על מבצע צבאי מוצע נגד איראן שעלול להוביל לעימות מיידי. זמיר סירב לפתוח במבצע ללא הערכת סיכונים ביטחונית מקיפה, בירור משפטי ואישור חתום מההנהגה המדינית בישראל. גורמים צבאיים חוששים שנתניהו עלול לנצל את המתיחות עם איראן לטובתו הפוליטית לקראת הבחירות בישראל, מה שעלול להוביל להסלמה מסוכנת