התביעה המדינה ביקשה חמש שנות מאסר לז'אנה נמצובה במקרה של מנהיגות ארגון "לא רצוי" ברוסיה ביקש התובע חמש שנות מאסר לבתו של הפוליטיקאי בוריס נמצוב, ז'אנה, במקרה של ארגון עבודתו של ארגון "בלתי רצוי" (חלק 3 של סעיף 284.1 לחוק הפלילי). כך דיווחה Mediazona. נמצובה עצמה כתבה שהסיבה למקרה היא קרן בוריס נמצוב לחופש, אותה ייסדה בגרמניה בשנת 2015. השלטונות הרוסיים הכריזו עליה כארגון "לא רצוי" באפריל 2024. לטענת התביעה, נמצובה "מארגנת" את המימון והתפקוד של הארגון, וגם "נותנת אפיון שלילי של אירועים שונים המתרחשים בפדרציה הרוסית".
בסוף יולי 2026, בית המשפט המחוזי של זמושבורצקי במוסקבה עצר אותה שלא בפניה בתיק הפלילי הזה, ובספטמבר היא הוכנסה לרשימת המבוקשים הבינלאומית. בספטמבר 2026, הקרן לדמוקרטיה וערכים ליברליים (FDLV), בראשות נמצובה, הוכרה גם כארגון "לא רצוי" ברוסיה. באוקטובר, משרד המשפטים הרוסי כלל את נמצובה במרשם "הסוכנים הזרים". אחד ממנהיגי האופוזיציה הרוסית, בוריס נמצוב, נהרג ב-27 בפברואר 2015 בגשר בולשוי מוסקבורצקי במרכז מוסקבה. עדיין לא נמצאו מתכנני הרצח. בקיץ 2015, ז'אנה נמצובה עזבה את רוסיה.